La chiesa sorge vicino al Palazzo Reale dei normanni. E’ uno degli esempi arabo-normanni meglio conservati, insieme al piccolo chiostro benedettino ed al giardino in stile mediterraneo. Fu edificata nel 1136, su decisione di re Ruggero, su un monastero preesistente e fu data in affidamento ai Benedettini. L’abate di S. Giovanni d. E. era anche cappellano della Cappella Palatina all’interno del Palazzo Reale.
Semplicità e le volumetrie interne ed esterne fanno ascrivere la sua costruzione a maestranze del mondo arabo che operavano a Palermo e che i normanni utilizzavano nella costruzione dei loro edifici. Da alcune rovine all’interno del complesso, si evince la presenza di altri corpi di fabbrica preesistenti, databili tra il 900 e il 1136: anno di inizio costruzione del complesso.
